L'assolement et les rotations longues des cultures contribuent au maintien de la fertilité des sols. Les associations d'espèces ou de variétés renforcent la résistance des végétaux. Les engrais sont de nature organique ou minérale (composts, fumiers, engrais verts, poudre de roche...).
Les produits sont certifiés par l'un des six organismes agréés par les pouvoirs publics (Ecocert, Qualité France, Ulase, Agrocert, Certipaq et Aclave). Ces organismes, tous conformes à la norme Européenne EN 45011, pratiquent des contrôles annuels et des contrôles inopinés chez les producteurs et transformateurs de la filière bio pour certifier ou recertifier leur produit.
Leur action est complétée par celle de la Direction générale de la concurrence, de la consommation et de la répression des fraudes (DGCCRF) qui procède également à des contrôles et des analyses, en particulier dans les points de vente.
Les produits transformés doivent contenir au minimum 95 % d'ingrédients issus de l'agriculture biologique pour obtenir le label AB. Ils sont exempts d'additifs artificiels (conservateurs, colorants, exhausteurs de goût...).
Les entrants (eau, sel, auxiliaires...) font l'objet d'une "liste positive", annexe de la réglementation tient au ministère de européenne très régulièrement actualisée.
Les équivalences avec les autres pays
Au niveau international, l'agriculture biologique fait partie des lignes directrices du Codex Alimentarus. Des règles cadre privées sont également édictées par l'Ifoam (Fédération internationale des mouvements d'agriculture biologique).
Une soixantaine de pays dans le monde ont mis en place une réglementation ou sont en passe de le faire afin de faciliter leurs exportations. La CEE et les États-Unis possèdent les systèmes législatifs les plus exigeant: et qui font référence.
Douze des membres de l'Union européenne ont opté pour des labels nationaux qui coexistent avec des marque privées, et il existe aussi un label européen.
Dans le domaine des produits non alimentaires, il n'y pas de réglementation européenne mais des cahiers des charges privés ou nationaux.
Pour les cosmétiques, par exemple: label BDIH en Allemagne, label Cosmébio et mention Nature & Progrès en France. Pour les produits d'entretien, il existe des labels environnementaux (marque NF environnement, Eco-label européen) et pour le textile, des cahiers des charges pour la production de cuIture biologique et équitable (Skal, Demeter, Ifoam...) et pour la fabrication, de très nombreux labels écologiques, officiels ou privés.